Selon Thierry Souccar, directeur de la rédaction du site lanutrition.fr, et Isabelle Robard, auteurs d'un ouvrage récent (voir), près de 65 % des experts de l'Afssa ont des liens avec l'industrie, que tous ne déclarent pas.

Ce jugement est confirmé par le Canard Enchaîné du 19 novembre 2008 qui met en doute l'indépendance de l'Afssa en soulignant à nouveau le fait que de nombreux membres de son comité d’experts travaillent régulièrement avec l’industrie

JosĂ© BovĂ© connaisseur s’il en est de la problĂ©matique pense « que cet article ne va rien changer. L'AFSSA a toujours dĂ©fendu les OGM et ceux qui mènent aujourd'hui l'AFSSA sont pro OGM », a dĂ©clarĂ© le leader anti-OGM sur France-Info. "Il n'y a pas un rapport depuis dix ans de l'AFSSA qui soit opposĂ© Ă  la dissĂ©mination des OGM". PrĂ©cise BovĂ© qui dĂ©clare Ă©galement qu'"il y a 25 arguments scientifiques diffĂ©rents pour mettre en place la clause de sauvegarde" et non pas un seul rapport, et considère qu’il s'agit d'"une volontĂ© d'essayer d’inverser la situation au niveau de l'Europe".

Et c’est cet organisme qui cautionnerait en toute indépendance la culture du maïs transgénique MON 810 au prétexte qu’il est consommable, ce que les écologistes n’ont jamais nié, et qui permettra, s’appuyant sur c’est article, aux industriels de l’agro de faire l’impasse sur les vrais problèmes environnementaux que posent le transgénique, en toute indépendance gratuite, et pour le seul bien de l'humanité.